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DNA尿素PAGE电泳试剂盒

DNA尿素PAGE电泳试剂盒

产品编号:RTE4102

产品规格:60次

数量
价格 ¥600

TBE-尿素-PAGE电泳可以选择RTM501 单链DNA Marker(25-75 nt)RTM506 单链DNA Marker (15-120nt)作为分子量标准 


DNA尿素PAGE电泳试剂盒

DNA Urea PAGE Electrophoresis Kit

货号

名称

规格

RTE4102

DNA尿素PAGE电泳试剂盒

60

1mm12%胶)

产品组成:

货号

名称

规格

保存条件

AC2914-01

40%PAA(29:1)

100 ml

4

TB002

10×TBE

500 ml

RT

RU5080

尿素(电泳级)

220 g

RT

AP020P

APS(干粉)

5 ml

RT (配制后-20贮存)

TA0761-01

TEMED

0.5 ml

4,避光

DL080-01

2×TBE尿素上样缓冲液 (尿素变性胶)

1 ml

4

产品简介:

DNA尿素 PAGE 电泳是研究寡核苷酸电泳的重要研究手段。可以检测2-500碱基的寡核苷酸片段,理论上可以分辨出相差一个核苷酸的片段。

本公司提供的DNA尿素PAGE电泳试剂盒包含凝胶制备及电泳所需的全部试剂,用户只需自备制胶器具和蒸馏水,即可配制各种浓度的PAGE胶,使用方便。

按照每次制备7 ml 10%凝胶(大小10×8cm,1mm厚度)计算,试剂盒可使用至少60次。

贮存和运输:

    试剂盒按照标签温度贮存,有效期一年。试剂盒常温运输。

使用说明:

一、制备凝胶:

10% APS配制-5 ml

将0.5 gAPS干粉溶于5 ml灭菌水中,彻底溶解后分装,1 ml/支,-20℃备存,每次取一管使用。10% APS应尽量减少室温存放时间,以防失效。10%APS在4℃有效期为一周,-20℃有效期12个月。若发现凝胶聚合时间延长,应考虑更换使用-20度保存的10% APS。

1.1.参照凝胶模具说明书,装配好凝胶模具。

1.2.分离胶配制:根据表格一,将不同体积的成分混合,漩涡搅拌至尿素彻底溶解。

表一 TBE-尿素PAGE分离胶配方表 (总体积5 ml,适用于厚度1.0 mm小板胶)

单链DNA长度

最佳凝胶浓度

尿素(克)

40%PAA

29:1

10×TBE

补水到总体积

10%APS

TEMED

200-1000 nt

5%

2.1

0.625 ml

0.5 ml

5 ml

50 μl

5 μl

50-400 nt

8%

2.1

1 ml

0.5 ml

5 ml

50 μl

5 μl

40-350 nt

10%

2.1

1.25 ml

0.5 ml

5 ml

50 μl

5 μl

30-300 nt

12%

2.1

1.5 ml

0.5 ml

5 ml

50 μl

5 μl

10-150 nt

15%

2.1

1.875 ml

0.5 ml

5 ml

50 μl

5 μl

8-120 nt

20%

2.1

2.5 ml

0.5 ml

5 ml

50 μl

5 μl

1.3在凝胶模具中灌入适量分离胶溶液(对于mini-gel,凝胶液加至约距前玻璃板顶端1.5 cm或距梳齿约0.5 cm即可),然后在分离胶溶液上轻轻覆盖一层1-5 cm的水层,使凝胶表面保持平整。

1.4静置10-20分钟,待分离胶和水层之间出现一个清晰的界面后,说明凝胶已聚合。

注:凝胶的聚合时间与环境温度有关。夏天温度较高时,聚合较快;冬天气温低时,聚合时间会延长。可以根据环境温度的不同调节APS的加入量。

1.5去除覆盖在分离胶上的水层;按照表二将不同体积成分在一个小烧杯中混合;最后加入10%过硫酸铵和TEMED,轻轻搅拌使其混匀,避免产生气泡。

表二 TBE-尿素PAGE 4%浓缩配方表 (总体积2 ml,适用于1.0mm厚度胶)

各组份体积(ml

凝胶浓度

尿素

40%PAA29:1

10×TBE

灭菌水

10%APS

TEMED

4%

0.84

0.2 ml

0.2 ml

补水2 ml

20 μl

2 μl

1.6将浓缩胶溶液加至分离胶的上面,直至凝胶溶液到达前玻璃板的顶端;将梳子插入凝胶内,避免产生气泡。

1.7静置30-60分钟,等待浓缩胶聚合。

注:凝胶的聚合时间与环境温度有关。夏天温度较高时,聚合较快;冬天气温低时,聚合时间会延长。可以根据环境温度的不同调节APS的加入量。

二、电泳:

2.1. 预电泳:拔出梳子,1×TBE缓冲液彻底冲洗加样孔2-3次,去除残余的尿素。电泳槽内外加入适量1×TBE缓冲液稳压200 V预电泳30分钟。

注:试剂盒配套的10×TBE缓冲液仅够配制凝胶用,1×TBE电泳缓冲液请自己制备,配方如下:

终浓度

顺序

原料

1

5

89 mM

1

Tris [MW121.14]

10.8

54

2 mM

2

EDTA 2Na·2H2O [MW372.24]

0.744

3.72

89 MM

3

硼酸 [MW61.83]

5.5

27.5

 

4

超纯水最后定容至

1

5

 

 

最后pH8.2-8.3之间,可以不用调节pH,记录每批pH

2.2. 取 3-5 μl样品,加入等体积2×TBE尿素上样缓冲液,70℃处理5 分钟后立即冰浴,上样。

2.3.  连接电源线,打开电源开关,按照以下条件电泳。

 

恒电压

起始电流

结束电流

电泳时间

适用条件

推荐电压

200V

15-20 mA/板胶

10-15 mA/板胶

60+ min

最佳电压,最优的分辨率

2.4.  等待上样缓冲液的溴酚蓝指示前沿到凝胶底部时终止电泳,取出凝胶进行后续实验。

变性胶浓度

溴酚蓝

二甲苯菁

5%

35 nt

130 nt

8%

19 nt

75 nt

10%

15 nt

55 nt

15%

10 nt

52 nt

三、染色:

3.1 单链DNA可以用单链DNA PAGE电泳染色试剂盒(货号:RTS5103),核酸PAGE电泳染色试剂盒(货号:RTS5102)或核酸快速银染试剂盒(货号:RTS5101)进行染色。




实验示例:


1.    使用单链DNA PAGE电泳染色试剂盒(货号:RTS5103)染色:

                         

 

2.    使用核酸PAGE电泳染色试剂盒(货号:RTS5102染色:

                  


3. 使用RealSafe Red核酸染料(货号:GR002)染色:



4 使用核酸快速高灵敏度染色试剂盒(货号:RTS5101)染色





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使用RTE4102 DNA尿素PAGE电泳试剂盒 产品发表部分文章列表:

1. [2022 IF=9.23] Precision-SELEX aptamer screening for the colorimetric and fluorescent dual-readout aptasensing of AFB in food.

Author: Ying Li, Boyu Jia, Pengyue Song, Nan Long, Linchun Shi, Peng Li, Jiabo Wang,Lidong Zhou, Weijun Kong

Product: RTE4102 DNA尿素PAGE电泳试剂盒

Journal: Food Chemistry 436 (2024) 137661

Institution:School of Traditional Chinese Medicine, Capital Medical University

Paper link https://doi.org/10.1016/j.foodchem.2023.137661

 

 


 
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