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DNase I(RNase-free)

DNase I(RNase-free)

产品编号:RTT2104

产品规格:200U

数量
价格 ¥150

DNase IRNase-free

 

●  产品组成:

货号

名称

规格

RTT2104-01

DNase I RNase-free 1 U/μl

200 U

RTT2104-02

10×DNase Reaction Buffer

0.2 ml

RTT2104-03

10×EDTA终止液(25 mM

0.2 ml

-

RNase-free

1 ml

● 保存: -20℃贮存,有效期一年。

产品简介:

DNase I,即Deoxyribonuclease I,中文名称为脱氧核糖核酸酶I,是一种可以消化单链或双链DNA产生单脱氧核苷酸或单链或双链的寡脱氧核苷酸的核酸内切酶。DNase I水解单链或双链DNA后的产物,5'端为磷酸基团,3'端为羟基。 DNase I活性依赖于钙离子,并能被镁离子或二价锰离子激活。镁离子存在条件下, DNase I可随机剪切双链DNA的任意位点;二价锰离子存在条件下,DNase I  可在同一位点剪切DNA双链,形成平末端,或1-2个核苷酸突出的粘末端。该DNase I不含RNase (RNase free),可以用于各种RNA样品的处理。提供了用于DNase I失活所需的EDTA。

用途:制备不含DNA的RNA样品;RT-PCR反应前RNA样品中去除基因组DNA等可能的DNA污染;体外T7, T3, SP6等RNA  Polymerases催化的RNA转录后去除DNA模板;DNase I footprinting研究DNA-蛋白质相互作用;缺口平移(nick translatioin);产生DNA随机片段文库;细胞凋亡TUNEL检测中部分剪切基因组DNA作为阳性对照。

活性定义:

One unit of the enzyme completely degrades 1 μg of DNA in 10 min at37°C. 

DNaseI贮存缓冲液:

50mM Tris-acetate (pH7.5),10mM CaCl2,50% (v/v) glycerol

10×DNase Reaction Buffer:100m M Tris-HCl (pH7.5 at 25oC),25mM MgCl2,1mM CaCl2

DNaseI失活或抑制:

加入EDTA至终浓度为2.5mM后,65℃加热10分钟可使DNase I失活。酚氯仿抽提也可以使DNase I失活。金属离子螯合剂,达到毫摩尔/升浓度的锌离子,0.1%的SDS,DTT、巯基乙醇等还原剂,50-100mM以上盐浓度均对DNase I有显著抑制作用。

使用方法:

RT-PCR反应前RNA样品中DNA的去除:

 1.在RNase-free离心管中加入以下溶液:

组份

10μl反应体系

备注

RNA溶液

1-3 μg

RNA加入体积小于8 μl

10×DNase Reaction Buffer

1 μl

 

DNase I (RNase-free) 1 U/μl

1 μl

 

RNase-free

补至10μl

 

 

轻柔混匀

 

2. 37oC 孵育 30 分钟。

3. 向上述反应体系中加入 1μl 10×EDTA终止液,65oC 孵育 10 分钟以失活 DNase I。

注:在没有鏊合剂如 EDTA存在情况下加热,RNA 可被水解。

4. RNA样品即可直接用作RT-PCR反应的模板。

体外RNA反转录后模板DNA的去除:

1.  在每含有0.5 μg模板DNA的反转录反应体系中加入1U DNase I。

注:在某些情况下,模板DNA完全消化所需的DNase的量需通过实验进行摸索。

2.  37oC  孵育15分钟。

3.  酚/氯仿抽提失活DNase I。

体外RNA反转录后模板DNA的去除:

1.  参考如下表格设置反应体系:

组份

体积

10×Reaction Buffer for DNA Polymerase I

2.5 μl

3 dNTP Mixture (1mM   each, without the labeled dNTP) *  

1.25 μl

[α-32P]-dNTP, ~110TBq/mmol (3000Ci/mmol)

1.85-3.7MBq (50-100μCi)

DNase I (freshly diluted to 0.002U/μl)**

1 μl

DNA Polymerase I, E.coli

0. 5-1.5 μl (5-15 U)

Template DNA

0.25μg

RNase-free

25μl

*3 dNTP Mixture (1mM  each, without the labeled dNTP):分别取不含已经标记的 dNTP 外的 3 种 dNTP(100mM)  各 1μl 加入到 97 μl 的RNase-free水中混匀即可。例如标记的为 dATP,则需混合 dTTP、dCTP 和 dGTP 三种 dNTP 至每种的最终浓度为 1 mM。配制好的 dNTP 可存放于-20oC 以备后续使用。

**DNase I 可以用 1X Reaction Buffer for DNA Polymerase I 进行稀释。

10×Reaction Buffer for DNA Polymerase I:500mM Tris-HCl (pH7.5 at 25oC),100mM MgCl2,10mM DTT。

2. 立即 15oC 孵育 15~60 分钟。

3. 上述反应体系中加入1 μl of 0.5M EDTA(pH 8.0)终止反应。

4. 从中取出少量例如1 μl 检测标记效率。通常标记效率至少可以达到 108cpm/μg DNA。


 
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