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高分子量蛋白(大于150 kD)Western Blot攻略

高分子量蛋白(大于150 kDWestern Blot攻略

注:该文引自基因帮公众号天才试剂君文章,略有修改。  Ver.730875

选对凝胶很重要

三种最常见的凝胶系统包括Tris-Glycine, Bis-Tris and Tris-Acetate系统。

Tris-Glycine凝胶的pH8.6,且保质期很短,一般4-8℃保存有效期一个月。在跑胶的过程中,凝胶系统的pH还有上升的趋势,可达到9.5,这会导致蛋白降解和低分辨率。

Bis-Tris凝胶的pH~6.5,相对Tris-Glycine凝胶,稳定性和保质期都有所增加,4-8℃贮存可以保存一年。但这种凝胶更适合于低分子量电泳分离(低于200 kD),不适合高分子量蛋白电泳。

Tris-Acetate 凝胶的pH~7,跑大分子蛋白会呈现很高的分辨率,同时4-8℃贮存可以保存一年。

所以跑大分子蛋白时,我们推荐使用Tris-Acetate 凝胶(货号:RTD6162RTD6155)。

凝胶浓度很重要

既然选择了Tris-Acetate 凝胶,要考虑凝胶浓度的问题。凝胶浓度与孔径成反比:浓度越小,孔越大,较大的蛋白质更容易通过较大的孔,所以建议使用低百分比的Tris醋酸凝胶(货号:RTD6162),如6%等度胶。也可以使用梯度凝胶,但是制作梯度凝胶会恨棘手,需要一个梯度凝胶生成系统(货号:RT-GZY02),不过现在很多公司都会出售具有不同范围的梯度预制胶(货号:RTD6155),节省时间。

电泳内槽缓冲液需要添加抗氧化剂

Tris-醋酸电泳使用10×Tris-醋酸-SDS电泳缓冲液(货号:TA050),经典的Tris-甘氨酸-SDS电泳缓冲液无法兼容使用。由于DTTpH中性时,基本不随着样品泳动,为保证蛋白样品在电泳中维持还原力,Tris-Acetate 凝胶电泳时,电泳槽内槽缓冲液需要添加抗氧化剂(货号:TA1510),这样可以保证整个电泳过程中蛋白的变性还原状态,提高样品的分辨率。

● 四 提高转膜缓冲液中的SDS,减少甲醇

高分子量蛋白转膜缓冲液中的组成至关重要。如果有甲醇存在,大分子蛋白很容易沉淀,可以通过减少转膜缓冲液中的甲醇百分比(10%或更低)来避免这种情况发生。为了进一步确保蛋白质不会沉淀,考虑在转膜缓冲液中添加SDS至终浓度为0.05%-0.1%。SDS向蛋白添加均匀的负电荷,使得它们更容易从凝胶转移到膜上。高分子量蛋白的转膜缓冲液可以选择10×Tris-醋酸转膜缓冲液(湿转,粉末型)(货号:TA5030P

● 五 选择合适的转印膜

转印膜一般有PVDF膜或NC膜,跑大分子蛋白建议选择PVDF膜。如前面所说,如果有甲醇存在,大分子蛋白很容易沉淀。而PVDF膜可以不需要在转膜缓冲液中添加甲醇,目的蛋白转印的机会更高。PVDF膜有各种孔径尺寸,最常见的是0.22 μm和0.45 μm。与凝胶一样,较大的蛋白比较小的蛋白更容易穿过大孔隙。高分子量蛋白质可以用0.45μm膜(货号:ML-PV-131545-5)转移,避免使用0.22 μm孔径。

● 六 增加转印时间

在正确的选择完凝胶、转印膜及转移缓冲液后,转印正式开始。半干转快且方便,但不适用于大分子蛋白。大分子蛋白建议湿转,因为大分子蛋白转移时间很慢,推荐350-400 mA转移90 min 4℃,40 mA,转印过夜。

● 七 关于转印膜封闭

没有任何一种封闭试剂能通用于蛋白封闭。BSA通常作为NC膜的封闭液,但是对于PVDF膜,它的封闭效果并不是最好。大蛋白转膜后的封闭可以选择5%脱脂奶粉(货号:WN1070)。

另外,不要让PVDF膜在检测过程中的任何时间点干透,如果膜部分变干,可以让膜完全干掉,然后用甲醇重新润湿,之后用缓冲液浸泡,继续操作。